MBK - Növénybiotechnológiai Főosztály - Epigenetikai Csoport

Kutatási terület

Csoportunk a kis szabályozó RNS-ek (sRNS) és az epigenetikai változások szerepét vizsgálja növényekben. Munkánk során, összehasonlító genom szintű sRNS analízissel és sRNS biogenezis mutánsok felhasználásával szeretnénk azonosítani, hogy a sRNS-ek és egyéb epigenetikai változások milyen szerepet játszanak a növényi gének szabályozásában termésérés illetve növény – mikróba kölcsönhatás során.

 

Kutatási témák
 

A vírustünetek kialakulásáért felelős növényi faktorok molekuláris azonosítása ­– NKFIH kutatási pályázat keretében.

A növényi vírusok rendkívül változatos tüneteket és gyakran komoly gazdasági károkat okoznak, ezzel veszélyeztetve az élelmiszer ellátás biztonságát. Ennek ellenére nagyon kevés ismeret áll a rendelkezésünkre a vírustüneteket kialakító molekuláris mechanizmusok növényi génjeiről. Kutatásunk célja, hogy tanulmányozzuk a tünetek kialakulásának molekuláris hátterét, és azonosítsuk a vírustünetek enyhítéséért felelős növényi géneket. Ha sikerül megértenünk a tünetek kialakulásának folyamatát, akkor lehetőségünk nyílik arra, hogy gazdaságilag fontos növényekben mérsékeljük a vírustünetek súlyosságát és ez által a vírusfertőzések okozta termésveszteséget is.
 

A paradicsom termésérésének befolyásolása genomeditálással – NKFIH kutatási pályázat keretében.

Századunk egyik legfontosabb kérdése, hogy miként tudunk elegendő élelmiszert előállítani a Föld egyre növekvő népességének. A humán populáció továbbra is gyorsan gyarapszik és egy emberöltőn belül eléri a 9 milliárdot. Mivel az élelmiszertermelésre fordítható földterület mérete elérte a maximumát, az élelmiszerbiztonság megőrzése csak úgy érhető el, ha növelni tudjuk a termésátlagokat és ezzel egy időben csökkenteni tudjuk a termésveszteségeket is. A FAO előrejelzése szerint évente körülbelül 1,3 milliárd tonna termés megy veszendőbe a betakarítás után. Így a betakarítás utáni termésveszteségek csökkentése kulcsfontosságú eleme az élelmiszer-biztonság jövőbeni biztosításának. A betakarítás utáni termésveszteségek további negatív hatása, a megromlott termések extra hulladékgazdálkodási költsége, az üvegház gázok termelése illetve a termelés során felhasznált erőforrások elvesztése. A paradicsom az egyik legnépszerűbb zöldség a világon. A paradicsom a gazdasági és táplálkozástani jelentőségén túl a gyümölcsfejlődés és a termés érés fő modellje. A paradicsom termés érésének és polc idejének módosítása a nemesítési programok egyik fontos célkitűzése, mivel az befolyásolja a termés piacosságát és csökkenti a betakarítás utáni veszteségeket. Munkánk során a legkorszerűbb genomszerkesztési módszerek felhasználásával, olyan új genetikai alapanyagot fogunk létrehozni, ami segíti a nemesítőket a paradicsom termés eltarthatóságának megnövelésében. A megnövekedett eltarthatóság fontos gazdasági és környezetvédelmi következményekkel jár, mivel ez jelentősen hozzájárul a betakarítás utáni veszteségek csökkentéséhez.

Munkatársak

Munkakör: csoportvezető, tudományos főmunkatárs
Munkavégzés helye: 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert utca 4.
Telefon: +36 28526230
Fax: +36 28526101
E-mail: szittya.gyorgy[kukac]abc.naik.hu
Gorcsa Teréz
Munkakör: intézeti mérnök
Munkavégzés helye: 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert utca 4.
Telefon: +36 28526154
E-mail: gorcsa.terez[kukac]abc.naik.hu
Munkakör: tudományos főmunkatárs
Munkavégzés helye: 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert utca 4.
Telefon: +36 28526154
Fax: +36 28526101
E-mail: gyula.peter[kukac]abc.naik.hu
Munkakör: tudományos munkatárs
Munkavégzés helye: 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert utca 4.
Telefon: +36 28526154
Fax: +36 28526101
E-mail: sos.hegedus.anita[kukac]abc.naik.hu
Munkakör: Önkéntes, tudományos segédmunkatárs
Munkavégzés helye: 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert utca 4.
Telefon: +36 28526154
E-mail: toth.tamas[kukac]abc.naik.hu

Publikációk

  1. Gyula, P., Baksa, I., Tóth, T., Mohorianu, I., Dalmay, T., Szittya, G. (2018). Ambient temperature regulates the expression of a small set of sRNAs influencing plant development through NF-YA2 and YUC2. Plant Cell Environ., 41(10):2404-2417. doi: 10.1111/pce.13355
     
  2. Taller, D., Bálint, J., Gyula, P., Nagy, T., Barta, E., Baksa, I., Szittya, G., Taller, J., Havelda, Z. (2018). Expansion of Capsicum annum fruit is linked to dynamic tissue-specific differential expression of miRNA and siRNA profiles. PLoS One, 2018 Jul 25; 13(7):e0200207. doi: 10.1371/journal.pone.0200207.
     
  3. Czotter, N., Molnar, J., Szabo, E., Demian, E., Kontra, L., Baksa, I., Szittya, G., Kocsis, L., Deak, T., Bisztray, G., Tusnady, G., Burgyan, J., Varallyay, E. (2018). NGS of virus-derived small RNAs as a diagnostic method used to determine viromes of Hungarian vineyards. Microbiol., 9:122. doi: 10.3389/fmicb.2018.00122
     
  4. Kis, S., Salamon, P., Kis, V., Szittya, G. (2017). Molecular characterization of a beet ringspot nepovirus isolated from Begonia ricinifolia in Hungary. Arch Virol., 162:3559-3562. doi: 10.1007/s00705-017-3521-z.
     
  5. Baksa, I., and Szittya, G. (2017). Identification of ARGONAUTE/Small RNA Cleavage Sites by Degradome Sequencing. Methods Mol Biol., 1640:113-128. doi: 10.1007/978-1-4939-7165-7_7.
     
  6. Baksa, I., Nagy, T., Barta, E., Havelda, Z., Várallyay, E., Silhavy, D., Burgyán, J., Szittya, G. (2015). Identification of Nicotiana benthamiana microRNAs and their targets using high throughput sequencing and degradome analysis. BMC Genomics, 16:1025. doi: 10.1186/s12864-015-2209-6.
     
  7. Szittya, G. and Burgyán, J. (2013). RNA interference-mediated intrinsic antiviral immunity in plants. Curr Top Microbiol Immunol., 371: 153-81.
     
  8. Lopez-Gomollon, S., Mohorianu, I., Szittya, G., Moulton, V. and Dalmay, T. (2012). Diverse correlation patterns between microRNAs and their targets during tomato fruit development indicates different modes of microRNA actions. Planta, 236 (6): 1875-1887.
     
  9. Folkes, L., Moxon, S., Woolfenden, H.C., Stocks, M.B., Szittya, G., Dalmay, T. and Moulton V. (2012). PAREsnip: a tool for rapid genome-wide discovery of small RNA/target interactions evidenced through degradome sequencing. Nucleic Acids Res., 1–10 doi:10.1093/nar/gks277
     
  10. Mohorianu, I., Schwach, F., Jing, R., Lopez-Gomollon, S., Moxon, S., Szittya, , Sorefan, K., Moulton, V. and Dalmay T. (2011). Profiling of short RNAs during fleshy fruit development reveals stage-specific sRNAome expression patterns. Plant Journal, 67(2): 232-246.
     
  11. Szittya, G., Moxon, S., Pantaleo, V., Toth, G., Rusholme Pilcher, R.L., Moulton, V., Burgyan, J. and Dalmay, T. (2010). Structural and functional analysis of viral siRNAs. PLoS Pathogens, 6(4): e1000838. doi:10.1371/journal.ppat.1000838
     
  12. Pantaleo, V.*, Szittya, G.*, Moxon, S., Miozzi, L., Moulton, V., Dalmay, T. and Burgyan, J. (2010). Identification of grapevine microRNAs and their targets using high throughput sequencing and degradome analysis. Plant Journal, 62(6): 960-976

* Társ-elsőszerző

Programajánló

Jelenleg nincs aktuális esemény.